In Bayern stößt die Auswahl der Startchancen-Schulen nach Sozialkriterien auf vehemente Kritik. Die Vorsitzende des Bildungsausschusses, Ute Eiling-Hütig (CSU), befürchtet, „dass ein solch flächendeckender Sozialindex all diejenigen Schulen stigmatisieren würde, die dabei auf den hinteren Plätzen rangieren, und damit auch die Schülerinnen und Schüler“. Leider zwinge das Startchancen-Programm des Bundes in gewissem Maße dazu, einen solchen Sozialindex zu erstellen, kritisierte Eiling-Hütig im Landtag.